Polish r7 Dogfood Fixes

# Polish-r7: dogfood UX findings (bootstrap.sh upgrade/remove output polish)

## Goal

把 dogfood 報告（`docs/dogfood/2026-04-28-upgrade-remove.md`）找出的 6 個 UX 問題一次修光（dogfood 報告寫 7 個，但 #3「dirty-tree 文件 mismatch」實際已 align — UPGRADE.md line 31 寫「warn but continue」，不是 dogfood 寫的「clean tree required」，是 sonnet 之前讀錯。剩 6 個真改動）。

## Execution profile

- model: sonnet
- effort: small（單檔多處字串改動 + 一個 doc 同步）
- 2 commits（polish / archive）

## Background context

S-1 ship 後跑 4 scenarios dogfood 全 PASS、無 logic bug；6 個 cosmetic UX 問題待修。所有改動集中在 `bootstrap.sh`（4 段 function: `upgrade_dry_run`, `upgrade_apply`, `remove_dry_run`, `remove_apply`），加 `docs/UPGRADE.md` 一處字串調整為對齊 dogfood 觀察。

關鍵脈絡：
- bootstrap.sh line 85 = dirty-tree WARN（單行、無分隔）
- bootstrap.sh line 155 = `Would overwrite` 標題（dry-run + apply 兩種模式都用）
- bootstrap.sh line 234 = upgrade 完成 `Done. N files written. Run 'git -C $target diff'`
- bootstrap.sh line 347 = `Would delete` 標題（dry-run + apply 兩種模式都用）
- bootstrap.sh line 376 = `Would remove empty dirs`
- bootstrap.sh line 422 = remove 完成 `Done. N files deleted. Memory preserved at...`

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## Commit 1: `feat(bootstrap): polish upgrade/remove output (active tense, git status hint, settings count, dirty-tree visibility)`

修 6 處（按 dogfood report 編號）。**所有「Would ...」標題改成 dual-mode** — dry-run 維持「Would」，`--apply` 切換到 active tense。

### Fix #1 — active-tense headers when --apply

**bootstrap.sh line 155** `echo "Would overwrite (${#will_overwrite[@]}):"`：
改為 dual-mode（用 `$apply` flag 變數，已存在）：